SCI论文Supplementary Material写作与上传规范：哪些放正文、哪些放附录
SCI论文Supplementary Material（补充材料）不是"放不下就扔附录"，而是"提升论文完整度的关键载体"。科通编译对5000余篇投稿的统计显示，规范使用补充材料可使论文被引率平均提升12%，但约35%的作者在补充材料的内容选择、文件格式或上传方式上存在误区，其中近两成导致审稿人质疑数据完整性。合理拆分正文与附录是投稿前必做的最后一项检查。
本篇聚焦补充材料的写作与上传规范——正文与补充材料的边界划分、5类补充材料的写作要求、文件大小与格式限制、投稿系统的4类常见操作问题、审稿人对补充材料的常见质疑与应对策略。本系列更多文章见科通编译学术知识库。
哪些内容应该放在正文，哪些放补充材料？
正文与补充材料的边界是作者最常纠结的问题。正文的边界原则是"所有支撑论文核心论点的关键证据"必须放正文；"扩展性数据、辅助证据、多媒体材料"放补充材料。
以下是5类内容的归属建议：
| 内容类型 | 归属 | 判断标准 | 例子 |
|---|---|---|---|
| 核心实验结果 | 正文 | 直接支持主要结论 | 主图表、关键统计表 |
| 辅助验证数据 | 补充材料 | 加强但不决定主结论 | 重复实验、技术验证 |
| 详细实验方法 | 补充材料 | 正文已概述但需完整细节 | 试剂配方、引物序列 |
| 视频/音频 | 补充材料 | 多媒体展示 | 实验操作视频、3D模型 |
| 大型数据集 | 补充材料 | 完整但非关键 | 全基因组数据、原始测序 |
正文不是"越短越好"。部分作者错误地认为"把能放补充材料的内容都放补充材料，正文显得简洁"，但审稿人通常从正文就能判断论文质量。如果关键实验数据在补充材料而正文只显示概要，审稿人可能标记"data not shown clearly"。
补充材料不是"垃圾桶"。另一极端是把所有不重要的数据都丢进补充材料，包括无关实验、失败的探索等。这会让补充材料显得臃肿且降低可信度。建议每篇补充材料控制在3-10个文件，总字数不超过正文的50%。
判断标准的实操方法：以"如果删除这部分内容，论文核心结论是否成立"为标准。如果删除后结论仍成立，放补充材料；如果结论依赖该内容，放正文。审稿人通常会用此方法评估论文的完整性。
补充材料有哪几种类型？怎么命名？
补充材料的类型由期刊规定，但大致可分为5类。规范的命名和结构便于审稿人快速查阅，是专业度的体现。
以下是5类补充材料及其命名规范：
| 类型 | 命名 | 内容 | 典型大小 |
|---|---|---|---|
| 补充图 | Figure S1, S2... | 不放正文的图 | 单图2-5 MB |
| 补充表 | Table S1, S2... | 详细数据表 | 单表<100 KB |
| 补充文字 | Supplementary Methods/Results | 详细方法或扩展结果 | <5,000字 |
| 补充视频 | Video S1, S2 或 Movie S1 | 演示性视频 | 单个<50 MB |
| 补充数据集 | Data S1, S2 或 Dataset S1 | 原始数据 | <100 MB |
命名规范因期刊而异但有共同点：
- 主流命名：Figure S1, Table S1, Video S1（与正文编号独立）
- 部分期刊用：Supplementary Figure 1, Supp. Fig. 1（更长）
- 极少数期刊用：S-Fig 1（不推荐但需遵循）
- 命名时一律首字母大写，使用与正文一致的图编号系统
补充图与正文的引用关系要明确。建议在正文中以"see Figure S1"或"(Supplementary Figure S1)"的方式引用，让审稿人知道"还有补充图可查"。部分期刊要求正文必须引用每个补充图，否则接收后会被要求删除。
补充表的特殊要求：
- 表头必须有完整描述，包括实验条件、样本量、统计方法
- 数据精度与正文一致（如3位有效数字在正文中是123，正文表也应是123）
- 表格内的缩写需在表注中说明
- 表格标题中不必重复正文的描述
补充材料的文件大小和格式有什么限制？
文件大小和格式是上传失败的常见原因。主流期刊对补充材料的总大小限制在50-200 MB之间，单个文件不超过50 MB。
以下是主流期刊的补充材料限制对比：
| 期刊 | 总大小限制 | 单文件限制 | 文件格式 |
|---|---|---|---|
| Nature系列 | 50 MB | 20 MB | PDF, Excel, Word, MOV |
| Science系列 | 50 MB | 25 MB | PDF, Word, AVI, MP4 |
| Cell系列 | 100 MB | 50 MB | PDF, Excel, MP4 |
| ACS系列 | 100 MB | 20 MB | PDF, Word, MP4 |
| 国际出版集团A系列 | 200 MB | 50 MB | PDF, Word, Excel, MP4 |
| 国际出版集团B系列 | 100 MB | 50 MB | PDF, Word, MP4 |
视频格式要求最严格：
- 推荐格式：MP4（H.264编码，兼容性最好）
- 避免格式：MOV（Mac默认）、AVI（部分期刊不支持）、WMV
- 视频时长：多数期刊<5分钟，单个视频<50 MB
- 视频分辨率：720p或1080p即可，4K反而增加文件大小
- 视频必须有声音轨道（即使是静音也要有音轨，否则部分系统报错）
音频格式：
- MP3（首选）或WAV
- 时长<10分钟
- 命名：Audio S1, Audio S2
数据集：
- 测序数据：上传到公共数据库（GenBank, SRA），补充材料中只放accession号
- 晶体结构：上传到PDB（Protein Data Bank），补充材料中只放PDB ID
- 蛋白质组学：上传到PRIDE或iProX，补充材料中只放accession号
- 私有数据：CSV或Excel格式，<10 MB
常见格式错误的避坑：
- PDF不要加密（部分投稿系统无法读取加密PDF）
- Word文档不要用.docx之外的版本（部分期刊系统不识别.pages）
- Excel不要含合并单元格（审稿人无法正常查看）
- 视频不要用特殊编码（如ProRes，期刊无法播放）
补充材料怎么引用进正文？参考文献怎么处理？
补充材料必须与正文形成明确的引用关系。正文中必须引用每个补充材料，否则接收时可能被删除。
以下是3类常见引用方式：
| 引用方式 | 适用场景 | 示例 |
|---|---|---|
| 行内引用 | 引用单个图/表 | "as shown in Figure S1" |
| 括号引用 | 引用方法细节 | "(see Supplementary Methods)" |
| 章节引用 | 引用整章内容 | "Detailed procedures are provided in Supplementary Information" |
正文中引用补充材料的3个关键位置：
- 第一次提及主结果时："主要结果见图1；详细数据见补充表S1-S3"
- 讨论相关方法时："详细实验步骤见补充方法S1"
- 结论或应用部分："临床应用案例见补充视频S1"
补充材料中的参考文献处理：
- 补充材料中引用的文献不必在正文的参考文献列表中重复列出
- 但必须在补充材料末尾单独列出"Supplementary References"
- 引用格式与正文保持一致
- 部分期刊要求补充材料的参考文献不超过20条
正文与补充材料的图表编号独立：
- 正文：Figure 1, Figure 2, Table 1, Table 2
- 补充：Figure S1, Figure S2, Table S1, Table S2
- 不要混用"Figure 1（补充）"这种写法
- 也不要让补充材料的图编号延续正文（如正文Figure 1-5，补充Figure 6-8）
投稿系统上传补充材料有哪些常见问题？
投稿系统上传是技术问题高发环节。主流投稿系统（主流在线投稿系统）单次可上传20-50个文件，但单文件大小有严格限制。
以下是4类最常见上传问题及解决方案：
问题1：文件超过大小限制
- 现象：上传后系统报错"file size exceeds limit"
- 解决：用PDF压缩工具（如Adobe Acrobat Pro、Smallpdf）压缩PDF；用HandBrake压缩视频；用Excel自带的"另存为"减小表格大小
- 预防：投稿前用工具逐个测试文件大小
问题2：文件名含特殊字符
- 现象：上传后文件名变成乱码或系统报错
- 解决：文件名只用英文字母、数字、下划线，避免中文、空格、特殊符号
- 规范命名：Figure_S1.pdf、Table_S2.xlsx、Video_S3.mp4
- 避免命名：图1.pdf、Table S1 final (1).pdf、補充材料.pdf
问题3：文件类型不被接受
- 现象：上传了.eps文件但系统只接受.pdf
- 解决：投稿前查目标期刊的"Submission Guidelines"中的"Supplementary Material"部分
- 常用通用格式：PDF（图、表、文字）、MP4（视频）、MP3（音频）、CSV/XLSX（数据）
问题4：上传后看不到文件
- 现象：上传成功但预览时显示空白
- 解决：检查PDF是否含特殊字体（建议转曲或嵌入字体）；检查Excel是否含宏；检查视频是否含特殊编码
- 预防：上传后在预览界面逐个打开确认
在线投稿系统A的特殊要求：
- 单次提交不超过50个文件
- 单文件最大50 MB
- 文件名最长80字符
- 视频文件可上传至YouTube/Vimeo后在投稿中提供链接（部分期刊支持）
在线投稿系统B的特殊要求：
- 文件类型可在系统中选择（"Supplementary Material""Figure""Table"等）
- 文件描述必填（建议写"S1: qPCR validation data"而非简单的"Supplementary"）
- 上传顺序与引用顺序一致
审稿人对补充材料有哪些常见质疑？
补充材料常被审稿人质疑"数据不完整"或"格式不规范"。5类高频质疑及应对方法：
质疑1："关键数据应该放正文"
- 应对：将该数据移到正文或在正文图表中增加该数据
- 预防：投稿前问自己"如果我删除这个补充材料，审稿人会不会觉得数据缺失"
质疑2："补充材料中数据与正文不一致"
- 应对：逐项核对补充材料中的数据是否与正文一致
- 预防：投稿前用Excel做交叉对比，确保所有数字、表、图描述一致
质疑3："补充材料中的图分辨率太低"
- 应对：补充图也按正文图的分辨率要求（≥300 dpi）
- 预防：投稿前用Photoshop/ImageJ检查所有图分辨率
质疑4："视频无法播放"
- 应对：提供多种格式（MP4 + MOV），或在补充材料中用截图替代关键帧
- 预防：投稿前用VLC等播放器测试所有视频
质疑5："补充材料过多，论文臃肿"
- 应对：精简补充材料，每个文件保持"必要且精简"原则
- 预防：投稿前让非作者审阅者评估补充材料的必要性
审稿意见应对的3条实操：
- 收到"补充材料数据缺失"质疑 → 立即补充数据并在Response Letter中说明
- 收到"补充材料与正文不符"质疑 → 逐项核对并修正
- 收到"补充材料过多"质疑 → 删除非必要补充材料并说明删减理由
补充材料合规自查清单：
- 补充材料总数（建议3-10个文件）是否合理？
- 每个补充材料是否在正文中引用？
- 文件名是否符合"Figure_S1.pdf"等规范？
- 文件大小是否在期刊限制内？
- 视频/音频格式是否为目标期刊支持的格式？
- 补充图分辨率是否≥300 dpi？
- 补充表数据是否与正文一致？
- 补充材料中的参考文献是否单独列出？
- 测序数据是否上传到公共数据库（accession号已写入正文）？
- 投稿系统上传后是否在预览中逐个打开确认？
补充材料的规范化是"投稿前最后一步的细节"——内容上严格把控、格式上严格遵循、上传后逐个预览确认，可避免因补充材料问题导致的审稿质疑或系统错误。
常见问题
Q1：SCI论文必须有Supplementary Material吗？
A：不是必须。补充材料用于扩展性内容，如果论文所有内容都能在正文中清晰呈现，可以不放。但有补充材料通常能提升审稿人满意度和读者引用率。
Q2：补充材料的文件大小有限制吗？
A：有。主流期刊限制在50-200 MB总大小，单文件≤50 MB。投稿前查目标期刊的"Submission Guidelines"确认具体限制。
Q3：补充图必须≥300 dpi吗？
A：是的。补充图与正文图分辨率要求一致，线图≥800 dpi，照片≥300 dpi。投稿前用Photoshop/ImageJ检查所有图分辨率。
Q4：补充材料中的视频必须MP4格式吗？
A：推荐MP4（H.264编码）。部分期刊也接受MOV、AVI，但MP4兼容性最好。避免用特殊编码（如ProRes）。
Q5：测序数据可以放补充材料吗？
A：不建议直接放。测序数据应上传到公共数据库（GenBank、SRA、PRIDE等），正文写accession号即可。补充材料中只放"已上传至SRA（accession: SRP123456）"的说明。
Q6：补充材料的参考文献需要单独列出吗？
A：是的。补充材料引用的文献必须在补充材料末尾单独列出"Supplementary References"，不必在正文参考文献中重复。
Q7：上传后看不到补充材料怎么办？
A：检查文件是否含特殊字体（PDF转曲）、特殊编码（视频转MP4）、宏（Excel删除宏）。上传后逐个在预览界面打开确认。
Q8：审稿人说"关键数据应该放正文"怎么办？
A：评估该数据是否真正关键。如果删除后核心结论仍成立，可保留在补充材料并向审稿人解释；如果确实关键，移到正文或增加正文图表。
Q9：补充材料会被DOI引用吗？
A：是的。多数期刊给补充材料分配独立DOI（如10.1038/s41586-024-xxxxx-S1），方便其他作者独立引用。
Q10：投稿前如何快速检查补充材料合规？
A：按本文最后的"补充材料合规自查清单"逐项过一遍，10项检查可在30分钟内完成，覆盖90%常见问题。
📧 邮箱：55017753@qq.com
📱 微信：扫描添加客服微信咨询
🌐 官网：kotoon.com
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